至此，为期两个多月的法门寺地宫田野清理工程宣告结束。考古人员从此转入了室内清理阶段。差不多在这前后，在韩金科的具体组织和指挥下，地宫出土的文物已陆续转移到扶风县博物馆（原文庙）大殿及两厢内，以供室内清理之急需。
1987年5月2日，考古人员在经过短短几天的休整之后，又开始了新的工作。为使室内清理工作顺利进行，考古人员进行了重新调整和分工。总负责为李宏桢、石兴邦；现场业务总负责韩伟；行政总负责张廷皓；总协调韩金科。另外，划分了五个专业小组：
隐匿于地宫后室角落中的舍利宝匣
法门寺塔基与地宫清理后形状
金银器组
组长：韩伟（兼）
记录：曹纬
总账：傅升歧
称量：赵赋康
建卡：白金锁
出入库：王仓西　吕增福
丝绸、杂器组
组长：罗西章
记录：王占奎
总账：淮建邦
称量出入库：徐克诚
建卡：邵燕宁
技术组
王?　王亚蓉　冯宗游　单伟
照相组
王保平　刘合心　魏全有　阎大勇　黄埔校　李明
安全组
徐士先　袁治才
当这一切安排就绪后，考古人员便投入了繁忙而具有科学意义的室内清理工作。