袁耀麾下目前以两曲一千人为一“小部”。小部的军事主官名曰军司马，也称千夫长、小校。这也就是吕岱刚来投奔时的官职。
五曲两千五百人为一“大部”。大部的军事主官名曰校尉，副手为军司马小校。
黄巾之乱之前，汉军基本用大部军制。大名鼎鼎的西园八校尉，就是八大部兵马，各有两千五百之众。
黄巾起义爆发后，朝廷下令郡县自募兵马，因为一开始义军数量不多，小部军制就开始盛行。
一小部兵马不过一千，这样的话方便州刺史和郡太守控制军队。如果一部人马是两千五百人，校尉的兵权就太大反而不好控制。
当战争开始后，各家军队数量逐渐增多，这个时候就开始盛行“别部司马”的临时军职。
别部司马高于军司马，最少统领一个小部，多则可以统领数个小部。其兵多少各随时宜，这是它最大的特点。