摆在马占山面前的出路有三条：
第一、忠实地执行国民政府之不抵抗命令，率军一走了之。这在当时东北军“二十万人齐解甲，竟无一个是男儿”大背景下，似乎是一个顺理成章的选择；
第二、像辽宁的臧士毅、吉林的熙洽那样，投到日本人的怀抱里。这样他照样可以“高官任做、骏马任骑”；
第三、奋起抗日。但“反思我兵力单薄，兵器不良，抵抗决难持久”。
马占山到底没有辜负对他有知遇之恩的吴大帅对他的期望，更没有辜负东北三千万父老兄弟的重托。在痛苦的思索之后，他下决心“要为国家争国格，为民族争人格，到省后，不管有何困难，必与日本一拚。”
10月11日，马占山乘大兴轮船由黑河启航，经哈尔滨改乘火车赴省城。19日晚，他到达齐齐哈尔，20日举行就职仪式，正式走马上任。
马占山此时面临的是一个乱摊子、险摊子——
敌情：日军自占领辽吉后，诱惑洮辽镇守使张海鹏，许以黑龙江省主席，令作前驱，张海鹏昏庸无知，甘为傀儡，10月11、12两日，日军运军火数列车交张使用，省城绅士赵作人等赴洮南迎接。……张逆气馁，不敢前来，日本遂调兵遣将自行出马矣。
财政：仅接省政府存款八万余元，并有未发行之黑龙江省纸币200万元，押在哈尔滨各银行。