痛心疾首的马文升立刻开始着手整风：裁撤大批老弱残兵，重新招募精壮勇士，制定完备的士兵训练操典和训练章程，任命优秀将领负责操练。一切推倒重来，累得吐血。但马文升知道，朱祐樘也知道，团营的问题不过是整个大明军队战斗力问题的冰山一角，甚至说句不怕丢人的话：比比全国落后地区，团营还算得上先进单位。
说到底，这还是个军事制度上的问题。
明朝的军事制度实行的是卫所屯田制，简单说来就是国家给士兵田地，士兵一边种田纳粮，一边操练武艺保家卫国。国家省了军费开支，士兵有了经济保障，可谓两全其美。可发展到后来，这“两全其美”变成了“两边全倒霉”。随着土地兼并日益严重，军队的屯田也遭受侵害，所以大量卫所人员缺编，士兵纷纷逃亡。更倒霉的是，达官显贵家修个院、盖个楼，都得调部队去施工。于是，以保卫国家为使命的大明军队彻底沦为了佃农、仆役和建筑工人，至于保卫国家之类的小事实在是顾不上了。