农民严格遵守停战协议，几支农军的代表于1525年3月中旬在门明根开会，为谈判拟定他们的要求，即《十二条款》（或《门明根十二条款》）。《十二条款》要求废除小什一税、继承税和农奴制，限制地租、劳役，归还被霸占的草地和森林，有权任免牧师等，并强调《圣经》是农民全部要求的基础，如有违反愿立即取消。关于条款的作者是谁，历来说法不一。它可能是农民的具体要求与茨温利宗教改革思想相结合的产物，是资产阶级共和派企图把农民战争纳入自己政治轨道的表现。[45]在实际斗争中，《十二条款》与《书简》一样在农民军中广泛传播。路德说：《十二条款》中有些要求是正确的，但有些要求“过高”，如要求废除农奴制度，没有按照《圣经》和法律办事。
士瓦本农军没有统一领导，而且良将稀少，纪律松弛，士气不振，远不是诸侯军队的对手。4月底，各支农军分别被特鲁赫泽斯的军队击溃。
1525年3月底起，法兰克尼亚爆发声势浩大的农民起义。斗争十分激烈。农民军占领几百个城堡和修道院，惩办了他们最痛恨的恶霸。年轻的魏因斯贝格伯爵异常残暴，见到起义农民，不分青红皂白一律勒死。4月中旬，由骑士弗洛里安·盖尔率领的农民军精锐部队“黑军”，活捉了那位伯爵，并将之判处死刑。伯爵请求用巨款赎免，农民说给两吨黄金也不行，血债要用血来还。农民一边击鼓，一边将他用梭镖乱刺而死。这件事震动全国，许多伯爵赶紧表面上归附农民军和宣誓遵守《十二条款》。“黑军”名震遐迩，敌人闻风丧胆，正如他们唱的革命歌曲那样：